低位肛瘘在手术的过程当中没有疼痛，一般都是在麻醉的状态下进行手术治疗，目前临床上多采用腰部麻醉的方式，手术之后由于需要排便，需要进行换药，手术的伤口会产生一定的疼痛，在换药或者排便之前，及早的使用止疼药物进行干预，大多数患者都可以耐受。　　在手术之后出