支原体肺炎主要是应用抗菌药治疗。由于咳嗽是支原体肺炎最突出的临床表现，可适当给予小剂量镇咳剂和祛痰药。病情严重有缺氧表现者应及时给氧。对喘憋严重者，可选用支气管扩张剂。对急性期病情发展迅速严重的支原体肺炎或肺部病变迁延而出现肺不张、肺间质纤维化、支气管扩张

注意呼吸道的清洁畅通，针对一些外在症状包括发热咳嗽等进行治疗主要有退热止咳化痰等等，高热时选用具有缓慢而持久作用的解热镇痛药，物理降温，另外也可以用一些祛痰剂目的在于使痰液变得稀薄容易排出，否则容易增加细菌感染的机会。支原体是细胞内菌，由于缺乏细胞壁对作用